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在食品工业，产品质量管理是通过酯化脂肪酸分析，确定脂肪中饱和脂肪酸与不饱和脂肪酸之比。因为脂肪酸中有很多异构体需要分离，通常方法是通过酯化为脂肪酸甲酯（FAMEs），再用色谱分析。以避免直接注射脂肪酸引起的峰拖尾和阻塞。

因为用于此分析的极性或中等极性的毛细管柱使用极限温度低，因此设定柱箱程序非常重要。对于所有的不同极性或中等极性的毛细管，脂肪酸流出会不同，因此首先要确定出峰顺序。ATC脂肪酸分析仪适用于各种脂肪酸，并提供从制备到方法的建立所有方法。